בחודש אוקטובר 2004 נערכה חפירת בדיקה בכרם מהר"ל (הרשאה מס' 4273-A; נ"צ — רי"ח 19940/72790, רי"י 14940/22790) בשטח המיועד לבנייה. החפירה, מטעם רשות העתיקות ובמימון י' לבקוביץ', נוהלה על ידי א' אושרי בסיוע ש' יעקב-ג'ם (מנהלה), א' האג'יאן (מדידות) ומ' שויסקיה (ציור חרסים).
כרם מהר"ל נמצא בחלק הדרומי-מערבי של בקעת מהר"ל. במקום היה היישוב הערבי הגדול באזור אג'זם עד לשנת 1948. מקור המים של היישוב היה בנביעה של עין אל-מקורה, כ-500 מ' מדרום-מזרח לאתר.
חפירות קודמות נערכו על ידי ע' עד וכ' סעיד בשטח היישוב, בפריפריה החקלאית (גת) ובשדה הקבורה (חדשות ארכיאולוגיות 118, חדשות ארכיאולוגיות 119, חדשות ארכיאולוגיות 120).
נפתח שטח (M; איור 1) שבו שני ריבועים ונחשפו ארבע שכבות מהתקופות הביזנטית, האסלאמית הקדומה, הממלוכית והעות'מאנית.
השטח, בתחום הרחבת היישוב, במדרון טבעי; בעבר נערכו בו עבודות בכלים מכניים ולפיכך השתמרות השרידים הארכיטקטוניים דלה.
בשכבה IV נחשפו קירות W6 ,W5 ,W3b ורצפת טיח (III) על תשתית אבנים קטנות שמונחות על סלע האם (איורים 2, 3). נתגלה מכלול כלי חרס מן התקופה הביזנטית: קערות (איור 4-1:4, 6, 8), קנקנים (איור 10:4, 11) ומכסה קדרה (איור 9:4).
בשכבה III מן התקופה האסלאמית הקדומה (האומיית, המאה הח' לסה"נ) נתגלו שרידי ריצוף. תוכנית המבנה משכבה IV ממשיכה בשכבה זו. מפלס הרצפות הורם. כלי החרס שנמצאו על הרצפה כללו שבר כלי ממורק שחור עשוי ביד (איור 13:4), פך מעוטר במשח לבן (איור 12:4) ונרות חרס מטין צלהב (איור 14:4, 15).
לשכבה II מן התקופה הממלוכית (המאה הי"ג לסה"נ) שייכים קירות W4 ,W3a ,W2 שתוכניתם אינה ברורה. קיר 3a נבנה על יסוד קיר קדום (3b) משכבה IV. מרצפת המבנה שהייתה עשויה כנראה מלוחות אבן שטוחים נחשף שריד דל בלבד. נמצאו שברי גוף מעוטרים בצבע וקערה מעוטרת (איור 5:4, 7).
בשכבה I מן התקופה העות'מאנית המאוחרת (המאה הי"ט לסה"נ) נתגלו קיר W1 וטבונים (לוקוסים 7, 9) ונמצאה מקטרת עות'מאנית (איור 16:4).
בארבע השכבות נתגלו שרידים של מבני מגורים שהשתמרו במצב גרוע אך תיארוכם וייעודם ברורים למדי. תוצאות החפירה חשובות בעיקר לצורך קביעת הגבול הצפוני של היישוב בתקופות אלו.