בסוף חודש אוגוסט ובתחילת חודש ספטמבר 2001 נערכה חפירת בדיקה בתחומי 'מחצבת אבן וסיד – בנימינה' שבאתר עינות שוני (הרשאה מס' 3488-A; נ"צ — רי"ח 19485/71531; רי"י 14485/21531). החפירה, מטעם רשות העתיקות, נוהלה על ידי א' גורזלזני, בסיועם של ש' יעקב-ג'ם (מנהלה), א' האג'יאן (מדידות), נ' זאק (שרטוט), ק' עמית (צילום שטח), צ' שגיב (צילום ממצא), ח' חלאילה (עיבוד כלי צור), א' אלטמרק (מעבדת מתכות), מ' בן-גל (רפאות), מ' שויסקה-ארנוב (ציור), ה' מיאניס (ארכיאומלקולוגיה) וכן א' ינאי, צ' הורוביץ וס' גולן. חברת אבן וסיד הגישה סיוע רב.
האתר התגלה בסקר שנערך בתחומי המחצבה בחודש יולי 2001 על ידי מ' פיילשטוקר, כתוצאה מפגיעה בקברים עתיקים במהלך עבודות כרייה. בסקר אותרו כמה עשרות קברי פיר מתקופת הברונזה התיכונה וכן מיתקנים מהתקופה הביזאנטית. האתר נמצא בגבול הדרומי של המחצבה, בגובה של כ-30 מ' מעל פני הים. המסלע באתר הוא דולומיט אפור מהפרט העליון של תצורת דיר חנא. בחפירה נחשפו שני שלבי בנייה מתקופת הב"ת 2א' (איור 1), שהושתתו על מדרגות סלע היורדות למזרח.
שרידי הבנייה מתקופת הב"ת 2א' נחשפו מתחת לשכבות בהן התגלה ממצא קיראמי מעורב, רובו מהתקופה הביזאנטית ומקצתו מהתקופה הפרסית, וכן אבני פסיפס. לשלב הבנייה המאוחר שייכים שני חדרים (לוקוסים 200, 208). קירות חדר 200 (W207 ,W205; רוחב ממוצע 0.7 מ') נבנו משתי שורות של אבני דולומיט בינוניות מסותתות גס; הם השתמרו לגובה של שניים-שלושה נדבכים. אל קיר 207 ניגשות שתי רצפות, מדרום (לוקוס 214) ומצפון (לוקוס 216). שתי הרצפות עשויות מאבנים שטוחות וחלוקי נחל בגדלים שונים, המונחים על מילוי אדמה (0.3-0.2 ס"מ עובי) המושתת על סלע האם שהוחלק. על רצפה 214 התגלתה מחט ברונזה שהשתמרה היטב (איור 2:2). על רצפה 216 התגלו עלי מבזלת, שרידים של תעשיית צור ושברי גוף של קנקנים מתקופת הב"ת 2א'. קירות חדר 208 (W224 ,W215 ,W209) נבנו משתי שורות של אבנים מסותתות גס והשתמרו לגובה של נדבך אחד או שניים. בקיר 215 נקבע פתח (1.1 מ' רוחב). מקירות 209 ו-224 נעקרו בימי קדם אבנים, כנראה לשימוש חוזר. בחדר נחשפה רצפה (לוקוס 218) הדומה לרצפה 214 מחדר 200. על רצפת חדר 208 התגלו באתרם כלי חרס ביתיים, חלקם ניתנים לרפאות, ובהם קנקנים, סירי בישול וקערות מראשית תקופת הב"ת 2א' (1900-2000 לפסה"נ; תחילת ימי השושלת הי"ב במצרים). חשיבותו של הממצא באתר בכך שמקורו באתר מגורים, בשונה מאתרים אחרים בהם נחשפו בעיקר קברים. עוד התגלו בחדר 208 ובסביבתו כלי צור, בעיקר להבים ונתזים משובררים, סכין ואיזמל, וכן שרידים של תעשיית צור, הכוללים גרעיני להבים, נתזים ופסולת. לא מן הנמנע כי חלק מפסולת הייצור של כלי צור קטנים מקורו באתר פרהיסטורי קרוב שטרם אותר. על רצפות המבנה מהשלב המאוחר התגלו בחפירה כמה צדפים ממין Glycymeris violascens, מחוררים בחלקם העליון על ידי אדם או כתוצאה משחיקה טבעית. ייתכן כי הם שימשו תליונים או קישוטים, כפי שמוכר מאתרים רבים במזרח הקדום, ובהם תל מבורך הסמוך מתקופת הברונזה התיכונה.
לשלב הבנייה הקדום שייך קיר (W204), שנחשף מדרום לקיר 209, נמוך ממנו. קיר 204 נבנה באבנים מסותתות גס. ממזרח ניגשת אליו רצפה (לוקוס 210) עשויה מעפר מהודק ומעט חלוקי נחל שטוחים, ועליה התגלו נר שמן וראש רומח מברונזה (איור 1:2) שהשתמרותו מצוינת. בחלק הדרומי-מערבי של חדר 200 התגלתה רצפה דומה לרצפה 210, הנמוכה מרצפת האבן מהשלב המאוחר. נראה שקיר 204 והרצפה הקשורה אליו הם חלק ממבנה שנמצא ברובו מחוץ לתחום החפירה. הממצא שהתגלה על רצפה 210 מתוארך לתקופת הב"ת 2א', ולכן נראה כי פרק הזמן שחלף בין שני שלבי הבנייה באתר קצר ביותר.
בבדיקה שנערכה מצפון לשטח החפירה נחשף המשכה של רצפת המבנה מהשלב המאוחר (לוקוס 221). ברצפה 221 התגלה קנקן שקוע, המיועד כנראה לאגירה. על הרצפה התגלו כלי כתישה רבים, בהם עליים ואבני שחיקה מבזלת. רצפה 221 תחומה מצפון בקיר (W227). ממזרח לרצפה הובחנו חציבות בסלע (לוקוסים 222, 223) ששימושן אינו ברור.
נראה כי השרידים בחפירה הם חלק מאתר מגורים מראשית תקופת הב"ת 2א'. האופי הביתי של הממצא שהתגלה על רצפות המבנה, הכולל כלי אגירה, כתישה ותפירה, מחזק הנחה זו. לא מן הנמנע כי האתר שנחשף עתה הוא חלק מעורף חקלאי של יישובים גדולים יותר בסביבה כמו תל בורגה ותל מבורך. הוא קרוב לנחל התנינים ולעינות שוני שהיוו מקורות מים רב שנתיים. הבנת האתר והממצא בו עשויים לתרום לחקר האוכלוסייה ודגמי היישוב בראשית תקופת הברונזה התיכונה.