בחודש מאי 1998 נערכה חפירת הצלה ברמת ישי (הרשאה מס' 2866-A; נ"צ — רי"ח 2164/7347; רי"י 1664/2347) לקראת בנייה. החפירה, מטעם רשות העתיקות ובמימון י' כהן, נוהלה על ידי א' אושרי (צילום וארכאוזואולוגיה), בסיוע צ' גל (מדידות ושרטוט), ע' שטרן (זיהוי כלי חרס) וג' מדברי (ציור כלי חרס).
נפתח שטח (50 מ"ר) ונמצאו שתי שכבות, הקדומה מן התקופה האסלאמית הקדומה והמאוחרת מן התקופה הממלוכית ובה שלושה שלבים אדריכליים.
על גבי סלע האם נמצאו חרסים ביזנטיים אחדים ללא ארכיטקטורה: קערות (איור 1:2, 2).
הפרט האדריכלי הקדום הוא בור גלילי חצוב בסלע לא מטויח, שדופנותיו סדוקות (לוקוס 8, 1.7 מ' עומק, 1.7 מ' קוטר; איור 1) ששימש אולי בור איסום (מטמורה). בבור שנמצא חתום, נמצאה קרמיקה מן התקופה האומיית: שלוש קערות ממורקות שחור ומעוטרות בחריטה (איור 5-3:2), פכים (איור 8-6:2) ופכיות (איור 9:2, 10).
על גבי סלע האם נמצאו שלוש יחידות אדריכליות נפרדות המעידות אולי על שלושה שלבים מן המאות הי"ג והי"ד לסה"נ. מבנה I הקדום (לוקוס 4; W10 ,W9 ,W5) שבתוכו נמצא מתקן בנוי. מבנה II (לוקוס 7) ובו קיר (W1) ורצפת טיח הניגשת אליו מדרום; מתחתיה נמצאה אמפורה שולחנית מהתקופה הממלוכית (איור 12:2). מבנה III (לוקוס 6) כולל את קירות W3 ו-W4. מדרום לקיר 4 (לוקוס 5) ומעל לפתח בור 8 נמצא ריכוז עצמות וכלים שלמים באתרם, קערה מזוגגת חום (איור 11:2) וסיר בישול עם ידיות מודבקות ומנוקבות מן התקופה הממלוכית (איור 13:2). כן נאספו שברי זכוכית מעטים. ממצא עצמות בעלי החיים מן התקופה האסלאמית הקדומה כלל: עז, בקר ועופות לא מוגדרים, ומן השכבה הממלוכית: סוס, בקר, שתי לסתות עליונות של חזיר, עופות וכן וחלקי שריון צב.