בחודש יוני 1998 נערכה חפירה בכפר מצר (הרשאה מס' 2879-A, נ"צ 23910-1/72795-6) לקראת הקמת מבנה מגורים. החפירה, מטעם רשות העתיקות ובמימון אחמד זועבי, נוהלה על ידי ע' מוקארי (צילום).
נפתח ריבוע ונחשפה בו רצפת בטון מודרני מכוסה באפר טבונים של הכפר המודרני. החפירה העמיקה עד לסלע הבזלת ולא נמצאו כל שרידים עתיקים.