בחודש פברואר 2003 נערכה חפירת הצלה בעין א-לוזה בשכונת סילואן בירושלים (הרשאה מס' 3824-A; נ"צ — רי"ח 22246/63028; רי"י 17246/13028) לאחר ששתי מערות טבעיות נפגעו במהלך סלילת כביש. החפירה, מטעם רשות העתיקות ובמימון חברת מוריה, נוהלה על ידי ז' עדוי בעזרת ב' טורי, ת' דעאדלה, י' נגר (אנתרופולוגיה פיזית), ו' פירסקי (מדידות ושרטוט) וד' וייס (GPS).
שתי המערות, בתחתית אחת השלוחות המשתפלות לנחל קדרון, כקילומטר אחד מדרום לשער האשפות, מרוחקות 50 מ' זו מזו (איור 1).
למערה A שני מרחבים (איור 2): מעוגל (8 מ' קוטר) ומלבני מדרום-מזרח לו. חלק ניכר מתקרת המערה קרס. נפתח ריבוע חפירה במרחב המלבני. תחת סחף שכלל חומר מודרני, התגלה מילוי אפור כהה וכמות גדולה מאוד של שברי כלי חרס מתקופת הברזל 2. כן התגלו עצמות אדם במצב השתמרות גרוע, הן הושארו במערה ומייצגות לפחות חמישה פרטים: תינוק בן יומו, ילד בן 2–4, שני צעירים בני 15–19 ובוגר בן 30–40.
למערה B (מטר אחד גובה מעל המילוי; 5.5 × 15.0 מ'; איור 3) שלושה מרחבים: מלבני בדרום (5.5 × 7.0 מ'), סגלגל במרכז (4.0 × 5.2 מ') ועגול בצפון (כ-3 מ' קוטר). בדופן המזרחית של המערה נמצא הפתח המלבני המקורי (0.75 מ' רוחב) המעוצב עם מסגרת
(0.75 מ' רוחב; 0.5 מ' גובה מבסיס המילוי). הסלע הסוגר את החלק הצפוני-מזרחי של המערה חסר ובחלקה הדרומי-מזרחי שנפגע בפעולת הפיתוח נחפר חתך בדיקה לרוחבה. הממצא כלל שברי כלי חרס מתקופת הברזל 2 ועצמות אדם מפוזרות במצב השתמרות גרוע.
מערה C, סמוך למערה A, לא נחפרה (איור 4). למערה חלל מלבני (כ-2.3 × 3.0 מ'; 0.85 מ' גובה מעל המילוי). הפתח (0.47 × 0.53 מ'; 0.48 מ' גובה מעל המילוי) בדופן המזרחית וניצבת בו באתרה אבן הגולל דמוית פקק. פתח נוסף התגלה בדופן הדרומית (0.55 מ' רוחב, 1.45 מ' עומק) והוא שימש כנראה מעבר לחדר נוסף או לכוך. נמצאו כלי חרס מהתקופה הרומית הקדומה וזוהו גולגלות ועצמות של 13 נקברים לפחות.