בחודשים אוגוסט-ספטמבר 2003 נערכה חפירת הצלה בחורבת פתורה צפון (הרשאה מס' 3981-A; נ"צ — רי"ח 18210-20/61125-35; רי"י 13210-20/11125-35) בעקבות עבודות לסלילת כביש חוצה ישראל. החפירה, מטעם רשות העתיקות, נוהלה על ידי א' פרץ וע' פדר, בסיוע ח' לביא וא' בכר (מנהלה), א' הא'גיאן (מדידות), צ' שגיב (צילום), נ' ז'ק (שרטוט) וכן פ' נחשוני וד' ורגה.
למרגלות גבעה מתונה נפתחו 12.5 ריבועים (200 מ"ר) ונמצאו שרידים דלים של שלושה קירות (W117, אורך 0.9 מ', רוחב 0.25 מ', גובה 0.21 מ'; W110, אורך 5.25 מ', רוחב 0.75 מ', גובה 0.32 מ'; W111, אורך 6.7 מ', רוחב 0.4 מ', גובה 0.18 מ') התוחמים מפלס אפור מעורב בחרסים רבים, זכוכית ועצמות (לוקוסים 112, 114, 115, 124,
127, 143, 153, 154). אלה הם ככל הנראה טרסות חקלאיות הבנויות על גבי הסלע הטבעי.
מתחת למפלס האפור ולמילויי אדמת הטרסות נמצאו שתי מערות טבעיות (לוקוסים 145, 146).
ממצא כלי החרס במילויי אדמת הטרסות כלל מעט שפות קנקנים מהתקופה הרומית הקדומה, קנקני עזה ביזנטיים, פכים, פכיות, סירי בישול, קערות, שבר קערה מעוטר בצלב), שברי נרות וזכוכית, עצמות ואבן בזלת המתוארכים לתקופה הביזנטית המאוחרת ולראשית התקופה האסלאמית הקדומה (המאות הו'-הז' לסה"נ).